• 2010年第29卷第4期文章目次
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    • 慢消化淀粉的结构基础和机理

      2010, 29(4):481-487. CSTR:

      摘要 (1153) HTML (0) PDF 570.20 K (3217) 评论 (0) 收藏

      摘要:葡萄糖是食品营养中重要的能量物质,维持血糖水平的平衡对于正常的生理活动,特别是中枢神经系统的正常运转至关重要。淀粉是食品中葡萄糖的重要来源,但是不同来源的淀粉以及食品加工方式的不同都会影响淀粉的消化性能而导致淀粉具有快消化、慢消化和抗性之不同。近来有关碳水化合物的营养研究表明,快消化淀粉由于其对血糖调节系统的胁迫可以引起许多疾病的发生,而慢消化淀粉则比较温和而有助于疾病的预防。抗性淀粉不能被人体吸收利用,但对于大肠的健康具有重要功能。相对而言,慢消化淀粉的机制以及制作方法还很缺乏了解,本文将侧重慢消化淀粉的结构基础和机理做比较全面的综述,以促进此领域的进一步发展。

    • 淀粉-配体复合物的制备及结晶结构研究

      2010, 29(4):488-490. CSTR:

      摘要 (546) HTML (0) PDF 169.75 K (1324) 评论 (0) 收藏

      摘要:以B-型微晶淀粉为原料,经二甲亚砜溶解后,分散到热水中,随后加入一定比例的硬脂酸、单硬脂酸甘油脂、棕榈酸和异戊醇的乙醇溶液中,再经过混合、结晶、离心分离、洗涤,制得淀粉-配体复合物。采用X-射线衍射仪对得到的复合物进行分析和测试,结果发现在单硬脂酸甘油脂∶淀粉质量比为1∶4的和硬脂酸∶淀粉质量比为1∶5的条件下制备的V-型复合物的晶型结构最优。

    • 从第五届国际药用菌大会看中国药用菌研究进展

      2010, 29(4):491-495. CSTR:

      摘要 (499) HTML (0) PDF 570.85 K (1672) 评论 (0) 收藏

      摘要:第五届国际药用菌大会于2009年9月5日至8日在中国南通召开。作为两年一次国际药用菌研究的盛会,大会讨论了药用菌的分类与鉴定、营养与医药价值、栽培与发酵生产等热点问题,几乎囊括了药用菌研究及产品开发的各个方面,其中大多将会继续成为未来若干年内国际药用菌研究的重要发展方向。这次会议的召开同样对中国药用菌的研发具有重要的借鉴意义。与国际药用菌研发强国相比,中国药用菌研究是机遇与挑战共存。

    • 微生物酪氨酸解氨酶的研究进展

      2010, 29(4):496-499. CSTR:

      摘要 (1068) HTML (0) PDF 426.56 K (1583) 评论 (0) 收藏

      摘要:微生物转化生产次生代谢物质是重要的方式,但已知的微生物中未发现次生代谢物质的前体物质肉桂酸-4-羟基化酶(C4H)和香豆酸,这限制了微生物转化生产一些次生代谢产物。酪氨酸解氨酶(TAL)能跳过C4H将L-酪氨酸(L-Tyr)转化为香豆酸,为此对微生物来源的TAL的酶学性质、晶体结构、催化机制及TAL基因工程方面的研究进行了阐述,发现了TAL研究中存在的问题并初步提出了解决思路。

    • HS-SPME-GC/MS分析花生油挥发性成分技术的优化

      2010, 29(4):500-507. CSTR:

      摘要 (483) HTML (0) PDF 300.39 K (2184) 评论 (0) 收藏

      摘要:采用顶空固相微萃取结合气相色谱-质谱技术,建立了花生油挥发性成分分析方法。通过单因素分析得出最佳萃取条件为:PDMS-DVB萃取头,搅拌状态,萃取温度50℃,萃取时间40min,解吸时间5min。GC/MS初步分析鉴定出花生油挥发性成分53种。

    • 甘氨酸螯合铁纳米脂质体对铁强化牛奶氧化稳定性和感官质量的影响

      2010, 29(4):508-513. CSTR:

      摘要 (443) HTML (0) PDF 918.85 K (1757) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究了以甘氨酸螯合铁纳米脂质体作为铁强化剂对牛奶氧化稳定性和感官质量的影响。通过反相蒸发法以蛋黄卵磷脂为主要壁材制备出了具有良好球形结构和均匀粒径分布的甘氨酸螯合铁纳米脂质体,将其加入牛奶中进行铁强化。分别用硫代巴比妥酸法、色差分析、粘度测定和浊度测定对牛奶铁强化前后及其贮藏期间的氧化稳定性和感官质量进行评价。结果表明:与以硫酸亚铁和甘氨酸螯合铁作为铁强化剂相比,以甘氨酸螯合铁纳米脂质体为铁强化剂的强化奶的脂质氧化程度更低,组织状态更稳定。

    • 微波与超声波提取杨梅汁多酚类物质的对比研究

      2010, 29(4):514-520. CSTR:

      摘要 (462) HTML (0) PDF 1.16 M (1580) 评论 (0) 收藏

      摘要:以杨梅汁为原料,采用微波和超声波对杨梅汁中的多酚类物质提取进行了对比研究,两种方法分别采用单因素及正交实验,探讨了最佳提取条件和参数。结果表明:微波提取的最佳工艺参数为乙醇体积分数为80%,微波功率500 W,处理时间25 s,液料体积质量比为4 mL∶1 g;提取多酚提取量为514.837 mg/L;超声波提取的最佳工艺参数为乙醇体积分数为60%,超声波功率500 W,处理时间35 min,液料体积质量比为4 mL∶1 g,多酚提取量为609.256 mg/L。超声波提取的杨梅多酚类物质的量多于微波提取的量。

    • 葱白多糖的降血脂功能及对酒精肝预防作用的研究

      2010, 29(4):521-525. CSTR:

      摘要 (738) HTML (0) PDF 973.45 K (1891) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究了葱白多糖对大鼠血脂水平的影响以及对小鼠脂肪肝的预防作用。在研究多糖的降血脂功能试验中,设对照组和葱白多糖低、中、高剂量组,分别为100、200、400 mg/kg(以体重计),连续给大鼠灌胃30 d后取尾血,测定血清TC、TG和HDL-C的含量。结果表明:多糖降血脂效果优于血脂康,且高剂量组降血脂效果优于低剂量组;高剂量组对大鼠TG降低显著、对TC降低不显著;各剂量组均对HDL-C升高显著。在研究多糖对小鼠酒精肝预防作用的试验中,设对照组和葱白多糖低、中、高剂量组(剂量同上),连续给小鼠灌胃30 d后,测定肝脏MDA、血清TG和GSH的含量。结果表明:多糖对酒精肝预防作用较水飞蓟素弱;高剂量组对TG降低显著、对GSH升高显著;各剂量组均对MDA降低显著。由此看来,葱白多糖对大鼠有降血脂功能,对小鼠的酒精肝预防作用较弱。

    • 糖酯酶促合成转化率的影响因素分析

      2010, 29(4):526-532. CSTR:

      摘要 (467) HTML (0) PDF 251.79 K (1481) 评论 (0) 收藏

      摘要:糖酯是典型的非离子型生物表面活性剂,具有多种用途和功能特性,广泛应用于食品、医药和化妆品等领域。酶促合成的糖酯较化学合成的具有更安全、更好的应用前景。为指导糖酯酶促合成工艺的优化,本文论述了反应器、反应体系、水分含量、反应温度、底物和酶等主要因素对糖酯酶促合成转化率的影响。

    • 免疫酶吸附法评价纳米金对抗体Fc端的吸附效果

      2010, 29(4):533-537. CSTR:

      摘要 (473) HTML (0) PDF 863.38 K (1945) 评论 (0) 收藏

      摘要:以简单、快速的微波技术制备出粒径约为15nm左右纳米金溶胶。为测定该纳米金对兔IgG抗体的吸附,扫描得到溶液吸附抗体前后的光吸收图谱,可以明显看到溶液最大光吸收峰从518 nm转移到526 nm,这种现象表明纳米金能够很好地结合抗体。为评价纳米金和抗体Fc端的吸附效果,以兔IgG抗体和酶标羊抗兔抗体反应后,测定上清液中酶标抗体对酶底物显色后O.D值的变化,结果表明,纳米金对抗体Fc端的吸附率在92%以上,证明该纳米金吸附主要是在抗体的Fc端。

    • 臭氧水和超声波协同作用在速冻西兰花中的应用研究

      2010, 29(4):538-543. CSTR:

      摘要 (390) HTML (0) PDF 1.20 M (1712) 评论 (0) 收藏

      摘要:由于速冻蔬菜加工过程中的热烫处理对组织细胞的破坏性大,造成大量水溶性营养物质损失,使产品品质下降。作者主要研究了臭氧水和超声波对速冻西兰花POD酶活、解冻后质构和营养成分的影响,利用臭氧水和超声波联合处理的新工艺降低速冻西兰花的酶活,使速冻西兰花的品质等得到了更好的保持。

    • 电致化学发光方法检测肉的新鲜度

      2010, 29(4):544-547. CSTR:

      摘要 (457) HTML (0) PDF 182.61 K (1486) 评论 (0) 收藏

      摘要:肉类的变质过程中伴随着硫化物和氨气的产生。基于电致化学发光的原理和方法,构建了MWNTs/PVA/铱配合物修饰电极,此电极对无机氨有很好的响应,实验中以MWNTs/PVA/铱配合物修饰电极为工作电极,铂丝电极为对电极,Ag/AgCl电极为参比电极,进行循环伏安-电致化学发光扫描,扫描范围为0.2~1.8V,扫描速率为100 mv/s,线性范围为1.8×10-7~1.0×10-9mol/L,检出限为1.2×10-13mol/L。实验表明,ECL响应值与肉的腐败程度具有很好的相关性,该法可用于肉品新鲜度的监控。

    • 鱼松压缩成型影响因素的研究

      2010, 29(4):548-552. CSTR:

      摘要 (345) HTML (0) PDF 225.88 K (1368) 评论 (0) 收藏

      摘要:以影响鱼松压缩成型的因素为研究对象,将影响因素分为原料的制备(打松时间、干燥时间),压缩模具形式(模具截面形状与大小),压缩工艺参数(加载速率、最终压力、保压时间)三个方面,以压缩损失率和成型块松弛比为试验指标,确定了各因素的影响趋势。为鱼松压缩成型设备的设计指明方向。

    • 硒强化剂的急性和蓄积毒性试验研究

      2010, 29(4):553-557. CSTR:

      摘要 (389) HTML (0) PDF 197.83 K (1422) 评论 (0) 收藏

      摘要:为安全生产补硒保健食品和保障食品安全提供科学参考依据。用保健食品常见的硒强化剂亚硒酸钠对小鼠进行不同剂量灌胃,通过急性和蓄积性毒性试验,系统研究硒对小鼠生长性能,组织病理变化,血常规、血液生化指标等的影响,建立小鼠硒中毒的动物模型。急性毒性试验表明:小鼠经口LD50为3.86 mg/kg;蓄积性毒性试验表明亚硒酸钠对小鼠有弱蓄积性。

    • 南果梨黄酮液稳定性研究

      2010, 29(4):558-561. CSTR:

      摘要 (351) HTML (0) PDF 751.97 K (1421) 评论 (0) 收藏

      摘要:以南果梨总黄酮含量、沉淀率及透光率为指标考察其水溶液的稳定性,结果表明:以透光率为主要澄清指标,通过澄清试验得出最佳澄清剂配方为:明胶25 g/dL、单宁5 g/dL;以沉淀率为主要指标,通过L9(34)正交实验得出稳定剂最佳配方为:EDTA二钠0.075 mg/mL、抗坏血酸0.05 mg/mL、柠檬酸钠0.05 mg/mL、聚合磷酸钠0.1 mg/mL;以黄酮质量浓度为主要指标,得出最佳保存条件为室温避光保存;最佳灭菌条件为90℃灭菌20 min。

    • 鳕鱼多肽的抗氧化活性及其分离纯化

      2010, 29(4):562-566. CSTR:

      摘要 (663) HTML (0) PDF 229.03 K (1713) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究了鳕鱼多肽的抗氧化活性及分离纯化。为获得高纯度的抗氧化肽,将鳕鱼多肽依次通过超滤、凝胶过滤层析、阴离子交换层析(Q-FF)和反相高效液相色谱层析(RP-HPLC)进行分离纯化。结果表明:鳕鱼多肽具有很强的清除羟自由基的能力、清除DPPH的能力和还原能力;经Q-FF柱层析分离得到了B1、B2和B33个组分,B2经RP-HPLC检测显示为单一峰,获得了纯度较高的鳕鱼多肽,这为鳕鱼多肽的开发利用提供了科学理论依据。

    • 阿拉伯胶对马铃薯淀粉糊化及流变性质的影响

      2010, 29(4):567-571. CSTR:

      摘要 (429) HTML (0) PDF 775.74 K (1909) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究了阿拉伯胶对马铃薯淀粉糊化及流变性质的影响,考察了马铃薯淀粉/阿拉伯胶混合体系在盐、柠檬酸、糖等不同介质下的糊化性质。RVA结果表明在水溶液中随着阿拉伯胶含量的增加,混合体系的峰值黏度显著降低,具有更好的热稳定性,但在冷却过程中,淀粉黏度明显上升,回值略有增加。添加胶体后,马铃薯淀粉在盐溶液及柠檬酸溶液中的峰值黏度稍有降低,在糖溶液中则表现出更高的黏度。静态流变实验显示不同混合体系均表现出剪切变稀性,添加胶体后,体系假塑性增强,滞后环面积明显减小。

    • 乳酸丙二醇酯的非水相酶催化合成及应用研究

      2010, 29(4):572-577. CSTR:

      摘要 (452) HTML (0) PDF 305.94 K (1452) 评论 (0) 收藏

      摘要:以乳酸和丙二醇为原料,以一种固定化的假丝酵母脂肪酶为催化剂,催化合成了乳酸丙二醇酯,并对比了乳酸、丙二醇和乳酸丙二醇酯的保湿性和吸水性。研究确定的最优反应条件为:50 mL正己烷为溶剂,初始乳酸浓度为0 mol/L,丙二醇浓度为0.4 mol/L,加入固定化脂肪酶0.2 g,ZGS高效耐酸分子筛添加量2.0 g,反应温度50℃,以0.01 mol/(L.h)的速度滴加脱水乳酸20 h,搅拌催化反应,反应64 h结束,乳酸转化为乳酸丙二醇酯的酯化率达到97.3%。反应后纯化得到的产品质谱分析和红外光谱分析结果证实为乳酸丙二醇酯,GC质量分数达到99%以上。乳酸丙二醇酯的保湿性和吸水性试验表明:在相同的温度和湿度条件下,乳酸丙二醇酯的保湿效果比乳酸和丙二醇好,吸水性与丙二醇相当。乳酸丙二醇酯应用到卷烟中,可增加烟气舒适度,降低烟气干燥感。

    • 高效液相色谱法测定烟草底料中低聚糖的含量

      2010, 29(4):578-580. CSTR:

      摘要 (334) HTML (0) PDF 581.68 K (1496) 评论 (0) 收藏

      摘要:建立了一种检测烟草底料中低聚糖(水苏糖、棉籽糖、蔗糖)的高效液相色谱分析方法。采用Waters Sugar Pak1钙型阳离子交换色谱柱(6.5mm×300mm,5μm);流动相为纯水;采用示差折光检测器进行检测;流量1.0 mL/min;柱温85℃;外标法定量。结果显示:3种糖的线性关系良好,相关系数在0.9991~0.9997之间;精密度、稳定性的相对标准偏差(n=5)都低于4.7%;平均回收率为96.9%~103.5%;检出限为3.5~4.0μg/mL。该方法前处理简单、快速,应用本方法可测定烟草底料中水苏糖、棉籽糖和蔗糖的含量变化。

    • MBR中厌氧氨氧化运行特性及微生态结构

      2010, 29(4):581-588. CSTR:

      摘要 (391) HTML (0) PDF 351.28 K (1583) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究了膜生物反应器(MBR)中厌氧氨氧化(Anammox)的运行特性与微生态结构变化。采用含氮模拟废水进行试验,最终获得粒径集中在0.2~1 mm的红褐色厌氧氨氧化颗粒污泥。运行结果显示,厌氧氨氧化菌能够承受的容积负荷达0.245 kgTN/(m3.d);总氮、NH4+-N和NO-2-N去除率分别达到80%、81%、91%。水力负荷冲击试验表明,当HRT从14 h下降到7.9h时,NH4+-N、NO-2-N去除率相对稳定,分别保持在75%和85%左右,厌氧氨氧化仍然能够稳定进行。通过末端限制性酶切片断长度多态性(T-RFLP)试验发现,反应器运行完成后微生物呈多态性分布,优势菌突出,其中起Anammox作用的菌属主要为planctomyce、pirellula、gemmata、pseudomonas,这为厌氧氨氧化运行过程中微生物群落结构变化提供理论依据。

    • 粘细菌AHB103-1发酵生产抗肿瘤活性物质

      2010, 29(4):589-594. CSTR:

      摘要 (384) HTML (0) PDF 487.27 K (1215) 评论 (0) 收藏

      摘要:研究了培养基成分和发酵工艺条件对AHB103-1产生抗肿瘤活性物质的影响。结果表明,较优培养基为:碳源为玉米淀粉;氮源为酵母粉;碳氮比为12∶6;培养基中添加5 mg/L的Gly、Glu和Ala;10 mg/L的Try和Tyr;1.0 mg/L的LiSO4、MnCl2、Na2MoO4和NaH2PO4对抗肿瘤活性物质的生成有明显的促进作用。优化后的发酵工艺条件为:发酵周期7 d,起始pH 7.4,发酵温度30℃;接种种龄4 d;500 mL摇瓶装液量125 mL;摇床转速150 r/min。

    • 重组融合人血清白蛋白-人白介素-2 C125A突变体在毕赤酵母中的表达

      2010, 29(4):595-601. CSTR:

      摘要 (1042) HTML (0) PDF 509.94 K (2021) 评论 (0) 收藏

      摘要:构建编码人血清白蛋白-人白介素-2 C125A的重组表达质粒,在Pichia pastorisGS115中表达,获得具有较高IL-2活性的融合蛋白。设计并合成符合P.pastoris密码子偏好,且含有C125A突变的IL-2编码基因IL-2m,通过酶切连接方法将其与人血清白蛋白(HSA)的编码基因连接为融合蛋白HSA-IL2m的编码基因。克隆到表达质粒pPIC9K中,电击转化P.pastorisGS115感受态细胞,获得重组P.pastorisGS115/pPHIm基因工程菌。摇瓶发酵获得分泌表达产物。结果:Western blot鉴定结果显示该融合蛋白与IL-2、HSA的抗体都能发生免疫反应。经脱盐、冻干制备的粗蛋白的IL-2生物学活性为1.51×106IU/mg。结论:在P.pastorisGS115中成功表达了具有人白介素-2生物学活性的HSA-IL2m融合蛋白。

    • 圆弧青霉脂肪酶基因序列的生物信息学分析

      2010, 29(4):602-608. CSTR:

      摘要 (797) HTML (0) PDF 863.90 K (1528) 评论 (0) 收藏

      摘要:从圆弧青霉PG37中克隆了碱性脂肪酶(Lip I)基因,并采用生物信息学分析了PG37 LipI基因携带的遗传信息。序列分析结果表明:Lip I DNA序列全长1 480 bp,不存在重复序列,含有5个内含子,5’端存在TATAbox和多个转录因子结合位点;cDNA序列全长1 128 bp,包含了转录起始位点、5’和3’非编码区及858 bp的开放阅读框架;Lip I编码区对TGC、GAC、TTC、CAC、AAG、AAC和TAC这7种密码子使用频率最高;比对LipI基因与Pichia pastoris基因组中的密码子使用频率,其中有21个密码子使用频率的比值相差较大。

    • 鲢鱼骨骼肌轻酶解肌球蛋白基因的cDNA克隆

      2010, 29(4):609-616. CSTR:

      摘要 (302) HTML (0) PDF 834.11 K (1262) 评论 (0) 收藏

      摘要:通过RT-PCR法和3′-RACE法从冬季和夏季鲢鱼的骨骼肌中分离到两种肌球蛋白重链同工型基因,分别命名为低温型(sc-w)和高温型(sc-s)。两种同工型基因的cDNA序列包含了部分3′-翻译区和全部3′-非翻译区,编码了鲢鱼轻酶解肌球蛋白(light meromyosin,LMM)羧基端的一部分氨基酸序列。在终止密码子的上游和下游区域,两种同工型基因之间在核苷酸序列上显示了明显的差异,其序列同源性为79.5%,推断的氨基酸序列的同源性为88.1%。根据与草鱼和鲤鱼相关同工型氨基酸序列的比对结果,发现在15个氨基酸残基位点上鲢鱼低温型(sc-w)与草鱼10℃型(gc10)一致,但两者显示了与其它同工型不同的变异,并且其中的11个位点属高度保守性残基。这些结果似乎表明了基于低温驯化的淡水鱼表达的肌球蛋白重链同工型必须在它们的初级结构上发生某些氨基酸残基的变异才能有助于其适应低温的栖息环境,在蛋白质水平上则展现出完全不同于高温栖息鱼类的肌球蛋白功能和性质。另一方面,根据分子系统树的分析结果,表明了来自相似栖息环境温度的鱼的肌球蛋白重链之间具有更近的基因距离,进一步证明了环境温度对广温性淡水鱼肌球蛋白重链的基因歧化和功能进化的影响。

    • 2株中国红豆杉内生细菌代谢产抑菌活性物质的研究

      2010, 29(4):617-623. CSTR:

      摘要 (947) HTML (0) PDF 1.53 M (1355) 评论 (0) 收藏

      摘要:自秦巴山区野生中国红豆杉(Taxus chinensis)中分离的25株内生细菌中筛选出2株具有较广抑菌活性的菌株TC-3和TC-2,通过生物学特征研究和16S rDNA序列分析,初步鉴定为Bacillus sp.和Bacillus subtilis。在排除酸性产物和过氧化氢的干扰后,TC-3和TC-2菌株发酵上清液对金黄色葡萄球菌(Staphyloccocus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等革兰氏阳性菌和大肠杆菌(Escherichia coli)等革兰氏阴性菌具有较好的抑菌作用,而且对部分真菌也有抑菌作用;经胰蛋白酶、胃蛋白酶和蛋白酶K处理后发酵液抑菌活性略有下降,表明该活性物质为非蛋白成分,或起抑菌作用的非单一物质。该活性物质不同于一般细菌素,属于类细菌素。它具有很好的热稳定性,在酸性条件下稳定且活性高,对蛋白酶敏感性低,且具有较广的抗菌谱。

    • 解脂耶氏酵母URA3基因的敲除

      2010, 29(4):624-628. CSTR:

      摘要 (1120) HTML (0) PDF 393.42 K (2597) 评论 (0) 收藏

      摘要:构建了营养缺陷型解脂耶氏酵母菌株,使之用于遗传标记和高产香味物质γ-癸内酯。作者利用基因同源重组的方法敲除掉尿嘧啶合成酶关键基因URA3基因,用尿嘧啶营养缺陷型培养基(SD-URA)添加一定浓度的5-氟乳清酸(5-FOA)和尿嘧啶筛选获得转化子。实验表明:尿嘧啶营养缺陷型菌株在含有5-FOA和尿嘧啶的培养基上生长而野生型菌株不生长,从而建立了一种快速获得营养缺陷型解脂耶氏菌株的方法。

    • 基于底物类型的微生物燃料电池的产电特性

      2010, 29(4):629-633. CSTR:

      摘要 (360) HTML (0) PDF 237.89 K (1471) 评论 (0) 收藏

      摘要:针对目前太湖流域大量蓝藻水需销纳的状况,研究开发了从蓝藻水中回收电能同时将其中的有机污染物质降解的沉积型微生物燃料电池(Sediment Microbial Fuel Cell,SMFC)体系。作者主要考察了不同底物类型对SMFC体系产电特性的影响。结果表明,底物类型对所构建SMFC体系的运行特性有较大影响。功率密度峰值依蓝藻+乙酸钠、蓝藻、蓝藻+葡萄糖和空白体系的顺序递减,分别为15.59、12.72、10.52、8.35 mW/m2。COD去除率则依蓝藻+乙酸钠、蓝藻+葡萄糖、蓝藻和空白体系的顺序递减,分别为60.1%、27.2%、19.6%、18.1%。功率密度和COD去除率变化规律的区别,主要归因于发酵型底物葡萄糖的存在导致体系中去除的COD并非全部被产电微生物所利用。

    • 基于剖面隐马氏模型的多序列比对

      2010, 29(4):634-640. CSTR:

      摘要 (486) HTML (0) PDF 1.20 M (1994) 评论 (0) 收藏

      摘要:多序列比对被称为NP完全问题,是生物信息中最基本的问题之一。目前,广泛使用剖面隐马尔可夫模型解决多序列比对问题。作者在粒子群优化算法的基础上,提出了将量子粒子群优化算法用于剖面隐马尔可夫模型的训练过程,进而构建了一种基于剖面隐马氏模型和量子粒子群优化算法的多序列比对算法。从核酸序列和BaliBASE比对数据库中选取了一些比对例子进行了模拟实验,并与其他算法进行了比较,结果表明,所提出的算法能在有限的时间内不仅能找到理想的隐隐马尔可夫模型,而且能得到最优的比对结果。

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