分枝犁头霉WL511热稳定α-半乳糖苷酶基因克隆及序列分析

doi:10.3969/j.issn.1673-1689.2011.01.022

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分枝犁头霉WL511热稳定α-半乳糖苷酶基因克隆及序列分析
DOI:
                        10.3969/j.issn.1673-1689.2011.01.022
                    
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基金项目:国家自然科学基金项目(30570055);广东省科技攻关项目(2009B020313005);广东省自然科学基金博士启动基金项目(9451022401003873);广东药学院博士启动项目(2006JCX06)

Cloning and Sequence Analysis of a Thermostable α-Galactosidase Gene of Absidia ramose WL511

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构建并筛选耐热分枝犁头霉cDNA文库获得639 bp热稳定α-半乳糖苷酶基因片段,并以5′-RACE和3-′RACE技术获得上下游片段1817 bp和1092 bp,拼接得α-半乳糖苷酶全长序列2228 bp,其完整开放读码框为2142 bp,编码713个氨基酸,G+C含量43%;产物预测等电点5.2,预测相对分子质量81000。该基因(GenBank No.DQ234280)属α-半乳糖苷酶36家族,与其他来源的α-半乳糖苷酶基因同源性较低,与链霉菌Streptomyces avermitilis MA-4680的α-半乳糖苷酶同源性最高为38%。

Abstract:

A DNA clone containing α-galactosidase gene fragment(639 bp) was isolated from the constructed cDNA library of Absidia ramose WL511.The 5’-RACE and 3’-RACE techniques confirmed this gene’s upstream and downstream sequences(1817 bp,1092 bp) Sequences analysis revealed that this gene with the full length of 2228 bp made a complete open reading frame of 2142 bp encoding a polypeptide of 713 amino acid residues with predicted molecular mass of 81 kDa and predicted pI of 5.2.This gene(GenBank No.DQ234280),belonging to α-galactosidase 36 family,showed a very low homology with other sources of α-galactosidase genes.The most similarity was 38 % between the α-galactosidases of Streptomyces avermitilis MA-4680 and A.ramose WL511.

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李荷,游娟,顾取良,刘玉焕.分枝犁头霉WL511热稳定α-半乳糖苷酶基因克隆及序列分析[J].食品与生物技术学报,2011,30(1):124-130.

LI He, YOU Juan, GU Qu-liang, LIU Yu-huan. Cloning and Sequence Analysis of a Thermostable α-Galactosidase Gene of Absidia ramose WL511[J]. Journal of Food Science and Biotechnology,2011,30(1):124-130.

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