鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆和序列分析
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国家自然科学基金项目(30670057);农业部现代农业产业技术体系建设专项资金项目(nycytx-0502)


Cloning and Sequence Analysis of the Exopolysaccharide Biosynthesis Genes from Lactobacillus rhamnosus JAAS8
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    摘要:

    根据已报道乳杆菌胞外多糖生物合成基因的同源性,利用其保守区设计引物,扩增出鼠李糖乳杆菌JAAS8RmlA基因部分序列,并通过染色体步移法扩增出Rml(ACB)的序列。获得了鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因4.1 kb序列片段,编码4个可读框。利用BLAST和ClustalX程序对获得序列进行生物信息学分析,预测其结构和功能。结果表明:该序列与已知鼠李糖乳杆菌胞外多糖生物合成基因具有高度同源性,RmlA、RmlC和RmlB基因与dTDP-L-鼠李糖前体的生物合成密切相关。

    Abstract:

    To clone the RmlA gene in Lactobacillus rhamnosus JAAS8,degenerate primers were designed from the conserved domain of the exopolysaccharide biosynthetic genes of lactic acid bacteria(LAB).The distinctive PCR products with the expected size were amplified from L.rhamnosus JAAS8.The gene sequence(4.1 kb) of RmlACB and Orf1 were cloned by genomic walking method.Nucleotide sequence similarity analyses with GenBank sequences were performed using the BLAST and ClustalX software.GenBank database searching shows that the predicted protein products of the RmlACB genes from L.rhamnosus JAAS8 have highest similarity with the EPS biosynthetic genes of Lactobacillus.The genes RmlA、RmlC and RmlB are closely related to the biosynthesis of dTDP-L-rhamnose precursor.

    参考文献
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引用本文

戴大海,李盛钰,周义发,赵玉娟,张雪,曾宪鹏,杨贞耐.鼠李糖乳杆菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆和序列分析[J].食品与生物技术学报,2011,30(2):250-254.

DAI Da-hai, LI Sheng-yu, ZHOU Yi-fa, ZHAO Yu-juan, ZHANG Xue, ZENG Xian-peng, YANG Zhen-nai. Cloning and Sequence Analysis of the Exopolysaccharide Biosynthesis Genes from Lactobacillus rhamnosus JAAS8[J]. Journal of Food Science and Biotechnology,2011,30(2):250-254.

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  • 在线发布日期: 2014-06-17
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