投稿指南出版伦理版权说明 我要投稿
首页 > 过刊浏览>2016年第35卷第6期 >623-628. DOI:10.3979//j.issn.1673-1689.2016.06.010
PDF HTML阅读 XML下载 导出引用 引用提醒
氧化葡萄糖酸杆菌WSH-003中D-山梨醇脱氢酶关键基因的表达分析
作者:
作者单位:

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:


Analysis of D-Sorbitol Dehydrogenase Gene in Gluconobacter oxydans WSH-003
Author:
Affiliation:

Fund Project:

  • 摘要
    • |
  • 图/表
    • |
  • 访问统计
    • |
  • 参考文献
    • |
  • 相似文献
    • |
  • 引证文献
    • |
  • 资源附件
    • |
  • 文章评论
    摘要:

    G. oxydans WSH-003能够高效地将D-山梨醇氧化为L-山梨糖，是工业VC生产的重要菌株。全基因组测序显示，该菌中存在3种不同的D-山梨醇脱氢酶基因簇（sldh），但这3种基因簇在菌株氧化D-山梨醇过程中的表达情况还未确定。WYLY HX ，首先利用BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）软件在线比对，确定了3种酶，分别为一种FAD（flavin adenine dinucleotide）辅酶依赖的山梨醇脱氢酶（FAD-SLDH）和两种不同的PQQ（pyrroloquinoline quinone）依赖的山梨醇脱氢酶（PQQ-SLDH）。然后，利用新一代高通量转录组测序技术，对发酵过程5个时期（4、8、12、20 h和40 h）的菌体分别进行转录组测序（RNA-Seq）。结果表明，基因座位为O1G_RS0104395/O1G_RS0104400的sldAB2基因在5个时期的转录水平FPKM（Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped reads）值均很低，而基因座位为O1G_RS0105425/O1G_RS0105430的sldAB1和基因座位为O1G_RS0106820/O1G_RS0106825 /O1G_RS0106830的sldSLC基因的FPKM值较高，且都随着D-山梨醇的快速氧化而逐渐增大。研究结果表明，sldAB1和sldSLC基因为氧化葡萄糖酸杆菌WSH-003中主要表达的D-山梨醇脱氢酶基因。本研究成果为菌株中D-山梨醇脱氢酶的后续研发提供了方向。

    Abstract:

    Gluconobacter oxydans WSH-003 is an L-sorbose production strain，mainly used of industrial production of Vitamin C. It can effectively oxidize D-sorbitol into L-sorbose with a high yield. The whole genome sequence of G. oxydans WSH-003 reveals that there are three different gene clusters for D-sorbitol dehydrogenase，whereas the gene expression of these three gene clusters in this strain has not been studied. In this study，two D-sorbitol dehydrogenases were proved to be PQQ dependent D-sorbitol dehydrogenase（PQQ-SLDH） and one was FAD dependent D-sorbitol dehydrogenase（FAD-SLDH） by using the BLAST software in NCBI. The transcription analysis of strain cells from 4 h，8 h，12 h，20 h and 40 h in fermentation cultivation were further studied using the high through-out RNA-Seq technology. The result showed that sldhAB2 on gene locus O1G_RS0104395/O1G_RS0104400 had a very low transcript level （FPKM，Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped reads） in all 5 time points，compared with the high FPKM of sldhAB1 on gene locus O1G_RS0105425/O1G_RS0105430 and sldSLC on gene locus O1G_RS0106820/O1G_RS0106825 /O1G_RS0106830. Here，we illustrated that the gene cluster sldSLC and sldAB1 played an important role in the oxidization of D-sorbitol to L-sorbose，which may contribute to the further study of D-sorbitol dehydrogenase genes in the strain.

    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

胡于东,堵国成,陈坚,周景文.氧化葡萄糖酸杆菌WSH-003中D-山梨醇脱氢酶关键基因的表达分析[J].食品与生物技术学报,2016,35(6):623-628.

HU Yudong, DU Guocheng, CHEN Jian, ZHOU Jingwen. Analysis of D-Sorbitol Dehydrogenase Gene in Gluconobacter oxydans WSH-003[J]. Journal of Food Science and Biotechnology,2016,35(6):623-628.

复制
分享
文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:
  • 最后修改日期:
  • 录用日期:
  • 在线发布日期: 2016-11-02
  • 出版日期:

版权所有：《食品与生物技术学报》编辑部

地址：江苏省无锡市蠡湖大道1800号  邮政编码：214122

电话：0510-85913526  电子邮件：xbbjb@jiangnan.edu.cn

技术支持：北京勤云科技发展有限公司

微信公众号二维码

手机版网站二维码